Junoy J, Viéitez JM. 1988. Crustáceos intermareales de sustrato blando de la Ría de Foz (Lugo). Actas III Congr. ibér. Entomol.: 529-540.
Junoy J, Viéitez JM. 1989. Cartografía de los sedimentos superficiales de la Ría de Foz (Lugo). Thalassas, 7: 9-19.
Junoy J, Viéitez JM. 1990. Macrozoobenthic community structure in the Ría de Foz, an intertidal estuary (Galicia, Northwest Spain). Marine Biology 107: 329-339
Pérez Edrosa JC, Junoy J. 1991. Macrofauna intermareal de las playas de Area Longa, Peizas y Anguieira y Altar (Lugo, NW España). Thalassas, 9: 37-48.
Junoy J, Viéitez J M. 1992. Macrofaunal abundance analyses in the Ría de Foz (Lugo, Northwest Spain). Cahiers de Biologie Marine 33: 331-345.
Junoy J, Viéitez J.M. 1992. Biogeografía de las especies ibéricas de Spionidae (Annelida, Polychaeta). Actas del V Simposio Ibérico de Estudios del Bentos Marino, vol 2: 115-147.
Pérez Edrosa, JC. Junoy J.1993. Macrofauna intermareal de la ría de Fazouro (Lugo). En: Estudios del Bentos Marino. A. Pérez Ruzafa y C. Marcos Diego (Coord. Ed.). Publicaciones Especiales del Instituto Español de Oceanografía, 11: 275-281.
Junoy J. 1996. La ría de Foz. Comunidades bentónicas. Servicio de Publicaciones de la Diputación Provincial de Lugo. 210 pp.
Castellanos C, Hernández-Vega S, Junoy J. 2003. Cambios bentónicos en la ría de Foz (Lugo) tras la construcción de un espigón. Boletín Instituto Español de Oceanografía 19: 205-217.
Junoy J. 2003. Impacto ambiental del vertido del Prestige sobre la coquina (Donax trunculus) y las especies de la macrofauna de las playas de Galicia. Memoria del Proyecto EA2003-0014. Programa de Estudios y Análisis. Ministerio de Educación, Cultura y Deporte.
Junoy J, Castellanos C, Viéitez JM, de la Huz MR, Lastra M. 2005. The macroinfauna of the galician sandy beaches (NW Spain) affected by the Prestige oil spill. Marine Pollution Bulletin 50: 526-536.
De la Huz MR, Lastra M, Junoy J, Castellanos C, Viéitez J M. 2005. Biological impacts of oil pollution and cleaning in the intertidal zone exposed sandy beaches: preliminary study of the “Prestige” oil spill. Estuarine Coastal and Shelf Science, 65: 19-29.
Hernández-Vega S; Castellanos C.; Junoy J. 2005. Cartography of the surface sediments of the Ría de Foz (Lugo, northwest Spain) after the construction of a jetty. Thalassas, 21 :83-92
Pérez-Domingo S; Castellanos C; Junoy J. 2008. The sandy beach macro-fauna of Gulf of Gabès (Tunisia). Marine Ecology 29 (sup.1): 51-59
Junoy J, Viéitez JM. 2008. Informe sobre los trabajos realizados en el Laboratorio de Bentos de la Universidad de Alcalá con las muestras recogidas durantela campaña CALMEN07 (convenio SGM-UAH). Secretaría General del Mar, 140 pp.
Junoy J, Viéitez J M. 2008. Informe final sobre los trabajos realizados en el Laboratorio de Bentos de la Universidad de Alcalá con las muestras recogidas durante la campaña PALAMÓS08 (convenio SGM-UAH). Secretaría General del Mar, 110 pp
Bernardo-Madrid R, Martínez-Vázquez JM, Viéitez JM, Junoy J. 2012. Surf zone suprabenthos of two Galician beaches (NW Spain): A temporal study. Revista de Investigación Marina,19:191-196.
Junoy J, Bernardo-Madrid R, Castellanos C, Riera R, Viéitez JM. 2012. A temporal study of the macroinfauna of the beach most affected by the Prestige oil-spill (O Rostro, NW Spain) Revista de Investigación Marina,19: 368-371.
Templado et al. 2012. Guía Interpretativa. Inventario Español de Hábitats Marinos. Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente. Madrid.
Bernardo-Madrid R, Martínez-Vázquez JM, Viéitez JM, Junoy J. 2013.Two years study of swash zone suprabenthos of two Galician beaches (NW Spain). Journal of Sea Research 83:152-162.
Junoy J, Castellanos C, Viéitez JM, Riera R. 2013. Seven years of macroinfauna monitoring at Ladeira beach (Corrubedo Bay, NW Spain) after the Prestige oil-spill. Oceanologia 55: 393-407.
Junoy J, Castellanos C, Bernardo-Madrid R, Riera R, Viéitez JM. 2014. Macroinfaunal recovery on the beach most severely affected by the Prestige oil spill (O Rostro, Galicia, north-west Spain). Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom 94: 17-24.
Junoy J. 2015. Black beaches of Spain.The Marine Biologist, 4: 9-11.